Η γρίπη είναι μια οξεία νόσος που προσβάλλει το ανώτερο ή/και το κατώτερο τμήμα του αναπνευστικού συστήματος (μύτη, φάρυγγας, λάρυγγας, βρόγχοι) και προκαλείται από τρεις τύπους RNA ιών A,B, και C. Οι ιοί τύπου Α ή Β αποτελούν τα κύρια αίτια γρίπης στον άνθρωπο, ενώ οι περιπτώσεις γρίπης από ιούς τύπου C είναι πολύ σπάνιες. Τα συμπτώματα της γρίπης συνήθως περιλαμβάνουν υψηλό πυρετό, πόνους των μυών και των αρθρώσεων, πονοκέφαλο, έντονη κόπωση, καταρροή, πονόλαιμο και βήχα. Τα συμπτώματα αρχίζουν συνήθως 1–4 ημέρες μετά την προσβολή από τον ιό και διαρκούν 2–7 ημέρες. Μερικές από τις επιπλοκές που μπορεί να προκληθούν, συνήθως σε ομάδες υψηλού κινδύνου, είναι η πνευμονία από τον ίδιο τον ιό της γρίπης ή από μικρόβια, κυρίως από πνευμονιόκοκκο, η αφυδάτωση, οι κρίσεις άσθματος στα άτομα που πάσχουν από βρογχικό άσθμα, η παρόξυνση της χρόνιας βρογχίτιδας, η επιδείνωση της καρδιακής ανεπάρκειας ή του διαβήτη.

Ο αναπνευστικός συγκυτιακός ιός (Respiratory Syncytial Virus, RSV) προκαλεί λοιμώξεις των αναπνευστικών οδών σε ασθενείς όλων των ηλικιών και αποτελεί την κύρια αιτία των λοιμώξεων του κατώτερου αναπνευστικού συστήματος κατά τη διάρκεια της βρεφικής και παιδικής ηλικίας. Ο RSV προσβάλλει τα επιθηλιακά κύτταρα του ανώτερου αναπνευστικού συστήματος δημιουργώντας μεγάλα συγκύτια. Η νέκρωση των εν λόγω συγκυτίων, δημιουργεί φλεγμονώδη εκκρίματα και απόφραξη της αναπνευστικής οδού. Στη συνέχεια, η κάθοδος των ιών στο κατώτερο αναπνευστικό σύστημα, μπορεί να οδηγήσει σε οίδημα και σύμπτυξη των κυψελίδων προκαλώντας βρογχιολίτιδα και πνευμονία, που οδηγεί σε σοβαρή αναπνευστική νόσο που απαιτεί νοσηλεία. Στους περισσότερους ασθενείς, η λοίμωξη προκαλεί μόνο ήπια συμπτώματα που είναι συχνά δύσκολο να διακριθούν από αυτά του κοινού κρυολογήματος και άλλων ήπιων λοιμώξεων του αναπνευστικού.

Ο SARS-CoV-2 είναι ένα νέο στέλεχος του ιού που προκαλεί ένα εύρος επιπλοκών, από ένα απλό κρυολόγημα μέχρι το οξύ αναπνευστικό σύνδρομο τύπου 2 (SARS) και εξαπλώθηκε παγκόσμια σε μικρό χρονικό διάστημα με αποτέλεσμα ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας (WHO) να τον ανακηρύξει ως πανδημία τον Μάρτιο του 2020.

Οι ιοί αυτοί είναι εξαιρετικά μεταδοτικοί από το ένα άτομο στο άλλο όταν ένας ασθενής βήχει, φταρνίζεται ή μιλά και διασπείρει τους ιούς στον αέρα με τη μορφή μικρών αόρατων σταγονιδίων. Η συγκέντρωση πολλών ατόμων σε μικρούς και κλειστούς χώρους όπως και ο ψυχρός καιρός αυξάνουν την πιθανότητα μετάδοσης τους στην κοινότητα. Τα συμπτώματα των τριών λοιμώξεων είναι κοινά με αποτέλεσμα να είναι δύσκολη η διάκριση του ιού που προκαλεί την αντίστοιχη νόσο.

Το συγκεκριμένο τεστ επιτρέπει την ποιοτική ανίχνευση μεταξύ των δύο τύπων γρίπης Α και Β ( Flu A/B), του αναπνευστικού συγκυτιακού ιού (RSV) και του SARS-CoV-2 μέσω της Real Time RT-PCR σε δείγματα από ρινικό και φαρυγγικό επίχρισμα που λαμβάνονται από εκπαιδευμένους νοσηλευτές σε ειδικά διαμορφωμένο χώρο, στο ισόγειο του χημείου.

Το τεστ βασίζεται στον πολλαπλασιασμό των υψηλά διατηρημένων περιοχών στο M1-γονίδιο (Flu A/B), στο N – γονίδιο (RSV), τα γονίδια E (envelope) και N (nucleoprotein) του SARS-CoV-2 και την περιοχή του E-γονιδίου που είναι κοινή για όλους τους SARS-like coronaviruses (SARS-CoV, SARS-CoV-2).

Η μέθοδος ξεκινά με την εκχύλιση Νουκλεικων οξέων από το δείγμα που πραγματοποιείται αυτοματοποιημένα στους τέσσερις extractors προηγμένης τεχνολογίας που διαθέτει το εργαστήριο ελαχιστοποιώντας τον παράγοντα του ανθρώπινου λάθους και μεγιστοποιώντας την ευαισθησία της μεθόδου. Στη συνέχεια, ακολουθεί η μέθοδος της αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης που γίνεται από εξειδικευμένους μοριακούς βιολόγους του εργαστηρίου χρησιμοποιώντας πολλαπλασιαστές κορυφαίων εταιρειών σε μοριακές εφαρμογές, όπως της εταιρείας QIAGEN και DNA technology. Η παρουσία FluA, FluB, RSV και SARS-CoV-2 ανιχνεύεται από την αύξηση του παρατηρούμενου φθορισμού κατά τη διάρκεια της αντίδρασης και κάθε ιός ανιχνεύεται σε διαφορετικό οπτικό κανάλι. Το Internal Process Control (IPC), το οποίο προστίθεται κατά τη διάρκεια της εκχύλισης RNA, ανιχνεύεται στην ίδια αντίδραση με έναν σημασμένο ανιχνευτή και επιτρέπει την ανίχνευση αναστολής της RT-PCR από διάφορους παράγοντες. Δρα επίσης ως έλεγχος εξασφαλίζοντας ότι το ιϊκό RNA απομονώθηκε από το βιολογικό δείγμα, αποτρέποντας έτσι τα ψευδώς αρνητικά αποτελέσματα λόγω ανεπαρκούς ποσότητας γενετικού υλικού ή ακατάλληλης μεταφοράς του δείγματος.

Η ένταση του σήματος φθορισμού είναι ανάλογη της ποσότητας του ιϊκού φορτίου που υπάρχει στο δείγμα και ανιχνεύεται από τον real-time PCR πολλαπλασιαστή. Η υψηλή ευαισθησία της μεθόδου μπορεί να ανιχνεύσει ακόμα και το ελάχιστο ιϊκό φορτίο που υπάρχει στο δείγμα και να προσδιορίσει με ακρίβεια αν μια λοίμωξη σε ένα πιθανό κρούσμα, οφείλεται σε ένα από τους ιούς που αναφέρονται πιο πάνω, καθιστώντας το ένα πολύτιμο εργαλείο για τον γιατρό, ώστε να παρέχει στον ασθενή την εξειδικευμένη ιατρική φροντίδα.

Ο επαγγελματισμός και το ήθος που διακρίνουν το προσωπικό του εργαστηρίου μας όπως επίσης και οι προηγμένες τεχνολογίες και μέθοδοι που χρησιμοποιούνται μας καθιστούν στην πρώτη γραμμή για την έγκαιρη ανίχνευση των ιϊκων λοιμώξεων του αναπνευστικού.